Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RNF148Q8N7C7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RNF148Q8N7C7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RNF148Q8N7C7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RNF148Q8N7C7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RNF148Q8N7C7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RNF148Q8N7C7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RNF148Q8N7C7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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