Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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