Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP1Q86WV1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms