Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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