Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms