Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms