Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms