Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM78BQ5VT40 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM78BQ5VT40 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM78BQ5VT40 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM78BQ5VT40 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM78BQ5VT40 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM78BQ5VT40 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM78BQ5VT40 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM78BQ5VT40 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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