Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms