Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms