Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms