Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms