Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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