Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACSM3Q53FZ2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms