Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms