Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHKAPQ2M3C7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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