Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms