Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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