Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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VAMP3Q15836 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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VAMP3Q15836 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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VAMP3Q15836 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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VAMP3Q15836 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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VAMP3Q15836 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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VAMP3Q15836 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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