Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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