Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FRMPD4Q14CM0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms