Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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COL4A6Q14031 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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