Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H2Q13888 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms