Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms