Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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