Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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