Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms