Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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