Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms