Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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