Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PUDPQ08623 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms