Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms