Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms