Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN2Q02246 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms