Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms