Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms