Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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