Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms