Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC5A3P53794 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms