Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMSP52788 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms