Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTBP49356 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms