Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NESP48681 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NESP48681 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NESP48681 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms