Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms