Protein–RNA interactions for Protein: P40259

CD79B, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD79BP40259 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD79BP40259 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD79BP40259 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms