Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms