Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD34P28906 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD34P28906 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD34P28906 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD34P28906 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD34P28906 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD34P28906 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD34P28906 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD34P28906 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms