Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX2P28328 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms