Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms