Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms