Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CTSSP25774 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CTSSP25774 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CTSSP25774 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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